Purnanya pembangunan gedung beserta keseluruhan fasilitas pendukungnya
telah menjadikan  Taman Pintar Yogyakarta kini semakin lengkap dalam
menyajikan sarana pembelajaran berbasis sains dan teknologi yang bersifat
interaktif untuk mendukung kurikulum pendidikan di Indonesia. Penambahan
zona beserta alat-alat peraga pendidikan baru yang terdapat di Gedung
Kotak Lantai II saat ini sudah dapat dinikmati oleh pengunjung. Zona-zona
baru tersebut berisi: Zona Indonesiaku, terdapat antara lain Replika
Borobudur, Gamelan Elektronik dan Pembuatan Batik; Zona Jembatan Sains,
terdapat antara lain Bayangan Berwarna, Gaya Tak Tampak dan Sumur
Gravitasi; Teknologi Modern menampilkan antara lain Otomotif dan Pesawat;
Teknologi Populer menampilkan antara lain Hologram dan Robotik, juga
terdapat Perpustakaan. Pengunjung juga dapat mengunjungi Tapak Presiden di
area Playground dan Gedung Memorabilia yang terletak bersebelahan dengan
Gedung Oval yang berisikan antara lain tentang sejarah Karaton
Ngayogyakarta, Pura Pakualaman, Tokoh Pendidikan Nasional dan otobiografi
Presiden-Presiden RI.
Sejalan dengan penambahan zona, alat peraga serta program yang dirancang
khusus untuk memancing keingintahuan dan memicu kreativitas generasi muda
dalam mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi ini, Taman Pintar akan
memberlakukan tarif masuk yang baru mulai tanggal 25 Desember 2008, yang
didasarkan pada Peraturan Walikota Yogyakarta Nomor 42 Tahun 2008 tentang
Perubahan Peraturan Walikota Yogyakarta Nomor 32 Tahun 2007 tentang
Besaran Tarif Masuk Per Zona di Taman Pintar Kota Yogyakarta.
Adapun tarif masuk yang baru untuk kunjungan Gedung Heritage (PAUD) Barat
dan Gedung Heritage (PAUD) Timur adalah masing-masing Rp 1.000,-, tarif
masuk Gedung Oval dan Gedung Kotak Lantai II adalah Rp 5.000,-  bagi
anak-anak dan rombongan (siswa dan guru) dan Rp 10.000,- bagi dewasa.
Sementara untuk Gedung Memorabilia adalah Rp 1.000,- untuk anak-anak dan
rombongan (siswa dan guru) serta Rp 2.000,- untuk dewasa.